一、两者的定义
控制变压器是根据电器设备需要的电压和电流高低，把它们控制在一个需要的使用范围之内。控制变压器与普通变压器的区别：普通变压器主要是改变电压，控制变压器是传递信号的，隔离变压器是指输入绕组与输出绕组带电气隔离的变压器，隔离变压器用以避免偶然同时触及带电体，变压器的隔离是隔离原副边绕线圈各自的电流。
隔离变压器一般(但并非全部)是指1：1的变压器。由于次级线圈不和大地相连，次级任一根线与大地之间没有电位差(即两根线无零、火之分，任意一根对人体都不会形成闭合回路)，使用安全。常用作维修电源。
二、两者的区别
(一)、用途不同
控制变压器是作为电气控制回路的供电电源使用的，目的是为了满足不同用电电气元件的电压需求，隔离变压器的作用：
1、将变压器两端不同电压或要求的需要传送的电压信号，经过隔离变压器隔离传送，使该变压器两端不同的电压不会相互干扰或影响，例如某些可控硅或IGBT电路的驱动线圈；
2、需要不同阻抗匹配的，如某些音响功率放大器；
3、为了人身安全，如行灯变压器。
(二)、作用不同
控制变压器是为电气设备运行中为控制系统提供电源的，侧重于供电。隔离变压器是为防止用电设备受电源的谐波干扰，实际它是个性能较差的滤波器。一般控制变压器输出电压有6.3V、12V、24V、36V、5DV、110V、220V等，为降低成本，有些控制变压器只输出单一低电压，或三到五个电压；而隔离变压器一般地说变压比是1：1，两类变压器功能不同，因而无法通用。
三、两者的联系
比如在一个进口行车电气回路中，所有继电器接触器等电气都是220伏的，电源输入是3相4线的，本来可以直接利用零线组成控制回路的。但是这个行车有操控手柄，电气设计人员就利用了一个隔离变压器，次级作为电气控制回路的电源，由于这个次级回路没有接地端，即使人接触了这220伏的控制电压的其中一点也不会触电，所以这个变压器既是控制变压器，也是隔离变压器。
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